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磷是植物生長發育必需的重要元素之一，但是我國有74%的耕地土壤缺磷，土壤中95%以上的磷為無效磷，植物很難利用。長期以來，為了提高農作物的產量，在生產中人們大量使用磷肥滿足植物對磷的需求，但是磷肥施入土壤后易形成難溶性的磷酸鹽并迅速被土壤礦物吸附固定變成無效態磷，植物不能直接吸收，導致磷元素的利用率低，嚴重影響了農作物的生長，限制了農業生產的發展，所以提高土壤中磷的利用率具有重要意義。
大量試驗證實，向土壤中施用微生物菌肥，不僅能夠增加作物磷素吸收量，提高作物產量，還能極大提高磷肥利用率，減少農業資源污染，因此在農業生產中使用含有解磷微生物菌的新型肥料，是實現農業可持續發展的重要途徑。
我國約有60%的耕地缺鉀，耕地快效鉀含量每年都在下降，造成土壤中氮、磷、鉀3種元素比例失調，影響了農業的發展。利用化學鉀肥補鉀是我國農業中普遍使用并且見效較快的土壤快效鉀補充方法，但造成了土壤結構破壞、有機質含量下降，且污染嚴重、成本高、供不應求。然而土壤中95%的鉀為礦物鉀形態，存在于鉀長石和云母中，可供作物吸收利用只有的快效性餌不超過全鉀2%。不過在一定條件下，礦物態鉀、緩效性鉀與快效性鉀之間存在動態平衡。
微生物菌肥施用到土壤之后，可以從土壤中分離出的一種能分化鋁硅酸鹽和磷灰石類礦物的有益微生物菌種，能夠分解鉀長石、磷灰石等不溶性的硅鋁酸鹽無機礦物質，促進難溶性的鉀、磷、硅、鎂等養分元素轉化成可溶性養分，增加土壤中快效養分的含量，促進作物生長發育，提高產量。
微生物菌劑用十分簡便的方式體現了種植業生態施肥、平衡施肥和精細施肥，有“四兩撥千斤”生物調控的功效。多年的作物田間實驗表明，微生物菌劑施入土壤后，植物根部（主要為根毛、根尖）分泌物有益于益生菌的生長繁殖。
菌又可為植物根部生長提供良好的營養，實現“菌隨根長、根隨菌壯”。能將土壤中植物不能吸收利用的固化磷鉀,活化為可溶性的快效磷鉀，增補土壤中有效磷及快效鉀的含量。同時，轉化土壤中固定態的中微量元素為可溶性養分，為植物提供充足的磷鉀及中微量元素營養。另外，還可以減少化學肥料在土壤中的固定，降低了土壤中化學殘留，提高了化肥的利用率，既保證作物營養需求實現穩產增產，減少化肥的投入量。