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清朝時期，皇宮太醫院設立教習廳，負責皇宮御醫的考核和醫學典籍的儲存。至同治年間，御史胡慶源奏請整頓醫官以正醫學，遂于同治六年（1867年）改教習廳為醫學館。此時的醫學館是我國歷史上收藏醫學典籍最豐富的機構，從唐宋時期的醫學專著到清明時期的養生秘方應有盡有、包羅萬象。1900年，八國聯軍進軍北京，紫禁城中大大小小的殿院皆遭洗劫，醫學館也面臨著覆滅。幸好段太醫后裔段芝南將重要典籍藏于藥飲片中，這些中醫不傳經典遂得以保存。此后，段芝南帶著幸免于難的醫學典籍退隱民間，創立了融匯百家之長的“段芝堂”。
